Thành lập

Câu lạc bộ bóng đá Kon Tum được thành lập vào năm 1992.

Quá trình thi đấu

Từ khi thành lập đến năm 1999, Kon Tum thi đấu tại giải bóng đá A2 toàn quốc.

Năm 2000, khi hệ thống giải đấu bóng đá ở Việt Nam được tổ chức lại, Kon Tum thi đấu tại Giải hạng nhì quốc gia từ năm 2000 đến 2004 trước xuống hạng tại Giải bóng đá hạng ba quốc gia

Mùa giải hạng ba đầu tiên của Kon Tum tại Giải Bóng đá hạng ba quốc gia 2005 nằm ở bảng B cùng các đội bóng Thành Nghĩa Dung Quất Quảng Ngãi, Phú Yên, Hải Phòng B và Gia Lai B. Chung cuộc Kon Tum xếp hạng nhì với 9 điểm nhưng không được thăng hạng.

Từ năm 2005 đến 2013, Kon Tum vẫn miệt mài đấu tại Giải hạng ba quốc gia mong tìm kiếm một suất thăng hạng trở lại Giải hạng nhì. Bước ngoặt nằm ờ mùa giải 2013 Giải hạng ba quốc gia khi Kon Tum toàn thắng trước các đối thủ Lâm Đồng và Gia Lai B và đứng nhất bảng A, đồng thời có được một suất thăng hạng lên Giải hạng nhì quốc gia 2014.

Mùa giải đầu tiên trở lại Giải hạng nhì, Kon Tum tiếp tục thi đấu ấn tượng ấn tượng và đứng thứ nhì tại bảng B cùng các đối thủ Phú Yên, Bình Thuận và Lâm Đồng. Tuy nhiên, bước vào vòng Play-off thăng hạng, đội bóng đã thua Bình Phước với tỷ số 4-0 và bỏ lỡ suất lên chơi tại Giải hạng nhất quốc gia.

Tuy nhiên, bước sang mùa giải hạng nhì quốc gia 2015, Kon Tum thi đấu không tốt và đành ngậm ngùi xếp cuối bảng và xuống hạng.

Vào ngày 25/12/2015, Hội nghị Ban chấp hành Liên đoàn bóng đá Việt Nam (VFF) khóa VII diễn ra tại trụ sở VFF đã tuyên bố chấm dứt tư cách thành viên của câu lạc bộ Kon Tum do không có sự tồn tại của Liên đoàn bóng đá Kon Tum (đội bóng do Trung tâm thể dục thể thao tỉnh Kon Tum quản lí).[1]

Trở lại

Năm 2016, câu lạc bộ Kon Tum trở lại và thi đấu tại Giải hạng ba quốc gia 2016. Kon Tum xếp vị trí thứ 2 tại bảng A sau đội dẫn đầu là Phù Đổng FC thông qua hiệu số phụ (hai đội cùng 7 điểm, hiệu số Phù Đổng là +5, Kon Tum là +4). Tuy nhiên, Kon Tum được lên chơi tại Giải hạng nhì quốc gia 2017.

Từ năm 2017 đến nay, Kon Tum vẫn tiếp tục thi đấu tại Giải hạng nhì quốc gia.